基礎醫(yī)學和臨床醫(yī)學的區(qū)別主要有以下幾點：

1.專業(yè)學習的側(cè)重點不同

基礎醫(yī)學研究醫(yī)學基礎學科，如解剖、生理、生化、微生物等等學術(shù)性內(nèi)容，臨床醫(yī)學是以內(nèi)外婦兒、五官科、眼科、皮膚科等等臨床應用學科的內(nèi)容，學習的課程涵蓋幾乎所有的醫(yī)學課程，就是兩個醫(yī)學專業(yè)都需要學習基礎+臨床課程，只是重點側(cè)向部分課程；同時，臨床醫(yī)學專業(yè)還有一年的臨床實期，這是基礎醫(yī)學沒有的。

2.專業(yè)大方向和要求不同

基礎醫(yī)學主要是偏向理論學習和理論研究，其臨床醫(yī)學則更具實踐性。學習基礎醫(yī)學需要學生識記和掌握很多的理論知識，同時要參與很多的理論實驗，最終能驗證某個醫(yī)學理論或發(fā)展與創(chuàng)新某個醫(yī)學理論，因而學習基礎醫(yī)學的學生要有學術(shù)潛質(zhì)；而臨床醫(yī)學則要求學生膽大心細，直接面對病人，在學習理論知識的基礎上應對各種突發(fā)情況、判斷和處理各種疑難雜癥。

3.專業(yè)培養(yǎng)目標不同

基礎醫(yī)學專業(yè)培養(yǎng)具備自然科學、生命科學和醫(yī)學科學基本理論知識和實驗技能，能夠在高等醫(yī)學院校和醫(yī)學科研機構(gòu)等部門從事基礎醫(yī)學各學科的教學、科學研究及基礎與臨床相結(jié)合的醫(yī)學實驗研究工作的醫(yī)學高級專門人才。

臨床醫(yī)學專業(yè)本培養(yǎng)德、智、體、美全面發(fā)展，具有良好職業(yè)道德和人文素養(yǎng)，掌握基礎醫(yī)學和 臨床醫(yī)學基礎理論、基本知識和基本技能，具備常見病、多發(fā)病診治和預防能力，以及危、急、重癥的初步判斷和處理能力，從事基層醫(yī)療衛(wèi)生服務工作的高素質(zhì)實用型醫(yī)學專門人才。

4.就業(yè)方向不同

基礎醫(yī)學的畢業(yè)生今后主要從事研究工作，因而可以去各個研究所工作，或是在學校搞教學，或去生物技術(shù)公司、醫(yī)療技術(shù)公司等。另外，基礎醫(yī)學專業(yè)可以在大四申請出國讀，去美德這些基礎醫(yī)學做得比較好的國家做研究也是不錯的選擇。

臨床醫(yī)學專注于實際操作，也就是最好當醫(yī)生，可從事麻醉學、醫(yī)學影像學、醫(yī)學檢驗、放射醫(yī)學、視光學 、醫(yī)療美容技術(shù) 、醫(yī)學檢驗技術(shù)等多個方向的工作。